Protein–RNA interactions for Protein: Q3UH93

Plxnd1, Plexin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnd1Q3UH93 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plxnd1Q3UH93 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plxnd1Q3UH93 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Plxnd1Q3UH93 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Plxnd1Q3UH93 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms