Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nom1Q3UFM5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nom1Q3UFM5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nom1Q3UFM5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nom1Q3UFM5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nom1Q3UFM5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nom1Q3UFM5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nom1Q3UFM5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nom1Q3UFM5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nom1Q3UFM5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nom1Q3UFM5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nom1Q3UFM5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nom1Q3UFM5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nom1Q3UFM5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nom1Q3UFM5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nom1Q3UFM5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nom1Q3UFM5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nom1Q3UFM5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nom1Q3UFM5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms