Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFK8

Frmd8, FERM domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd8Q3UFK8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Frmd8Q3UFK8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Frmd8Q3UFK8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Frmd8Q3UFK8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Frmd8Q3UFK8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Frmd8Q3UFK8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Frmd8Q3UFK8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frmd8Q3UFK8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frmd8Q3UFK8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frmd8Q3UFK8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frmd8Q3UFK8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frmd8Q3UFK8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frmd8Q3UFK8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frmd8Q3UFK8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frmd8Q3UFK8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frmd8Q3UFK8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frmd8Q3UFK8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frmd8Q3UFK8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Frmd8Q3UFK8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frmd8Q3UFK8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frmd8Q3UFK8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frmd8Q3UFK8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frmd8Q3UFK8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frmd8Q3UFK8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frmd8Q3UFK8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frmd8Q3UFK8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frmd8Q3UFK8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frmd8Q3UFK8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Frmd8Q3UFK8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms