Protein–RNA interactions for Protein: Q3UAW9

Brf2, Transcription factor IIIB 50 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf2Q3UAW9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brf2Q3UAW9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms