Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trip13Q3UA06 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms