Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VwceQ3U515 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VwceQ3U515 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VwceQ3U515 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VwceQ3U515 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VwceQ3U515 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VwceQ3U515 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VwceQ3U515 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VwceQ3U515 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VwceQ3U515 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VwceQ3U515 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VwceQ3U515 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VwceQ3U515 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VwceQ3U515 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VwceQ3U515 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VwceQ3U515 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VwceQ3U515 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VwceQ3U515 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VwceQ3U515 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VwceQ3U515 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VwceQ3U515 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VwceQ3U515 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VwceQ3U515 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VwceQ3U515 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VwceQ3U515 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VwceQ3U515 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VwceQ3U515 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VwceQ3U515 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VwceQ3U515 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms