Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ulk3Q3U3Q1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ulk3Q3U3Q1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ulk3Q3U3Q1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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