Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1J1

Tfpt, TCF3 fusion partner homolog, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfptQ3U1J1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TfptQ3U1J1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TfptQ3U1J1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TfptQ3U1J1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TfptQ3U1J1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TfptQ3U1J1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TfptQ3U1J1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms