Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1F9

Pag1, Phosphoprotein associated with glycosphingolipid-enriched microdomains 1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pag1Q3U1F9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pag1Q3U1F9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pag1Q3U1F9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms