Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem35bQ3U0Y2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms