Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trappc9Q3U0M1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc9Q3U0M1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms