Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccndbp1Q3TVC7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms