Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q3TTJ4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q3TTJ4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms