Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQQ9

Uncharacterized protein C1orf112 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TQQ9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3TQQ9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms