Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc102aQ3TMW1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms