Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Gtf3c3Q3TMP1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtf3c3Q3TMP1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtf3c3Q3TMP1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtf3c3Q3TMP1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtf3c3Q3TMP1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtf3c3Q3TMP1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtf3c3Q3TMP1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtf3c3Q3TMP1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtf3c3Q3TMP1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtf3c3Q3TMP1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtf3c3Q3TMP1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtf3c3Q3TMP1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtf3c3Q3TMP1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtf3c3Q3TMP1 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtf3c3Q3TMP1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtf3c3Q3TMP1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtf3c3Q3TMP1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtf3c3Q3TMP1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtf3c3Q3TMP1 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gtf3c3Q3TMP1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.6 ms