Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR3

Nlrp4c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4cQ3TKR3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nlrp4cQ3TKR3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms