Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp39Q3TIX9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp39Q3TIX9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms