Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms