Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc69Q3TCJ8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms