Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccbe1Q3MI99 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccbe1Q3MI99 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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