Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNL4

UPF0728 protein C10orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3KNL4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3KNL4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3KNL4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3KNL4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3KNL4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3KNL4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3KNL4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms