Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-M3Q31093 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-M3Q31093 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-M3Q31093 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-M3Q31093 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-M3Q31093 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-M3Q31093 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-M3Q31093 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-M3Q31093 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-M3Q31093 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-M3Q31093 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-M3Q31093 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M3Q31093 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M3Q31093 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M3Q31093 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M3Q31093 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M3Q31093 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M3Q31093 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M3Q31093 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M3Q31093 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M3Q31093 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M3Q31093 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M3Q31093 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M3Q31093 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M3Q31093 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M3Q31093 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M3Q31093 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M3Q31093 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M3Q31093 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M3Q31093 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M3Q31093 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M3Q31093 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M3Q31093 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M3Q31093 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M3Q31093 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M3Q31093 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-M3Q31093 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms