Protein–RNA interactions for Protein: Q30KN7

Defb26, Beta-defensin, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb26Q30KN7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Defb26Q30KN7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Defb26Q30KN7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Defb26Q30KN7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms