Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbp8Q2V6D6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gbp8Q2V6D6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms