Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd300lgQ1ERP8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd300lgQ1ERP8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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