Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Myo3bQ1EG27 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Myo3bQ1EG27 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Myo3bQ1EG27 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Myo3bQ1EG27 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Myo3bQ1EG27 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Myo3bQ1EG27 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Myo3bQ1EG27 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Myo3bQ1EG27 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Myo3bQ1EG27 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Myo3bQ1EG27 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Myo3bQ1EG27 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Myo3bQ1EG27 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Myo3bQ1EG27 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Myo3bQ1EG27 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Myo3bQ1EG27 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Myo3bQ1EG27 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms