Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
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