Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGM9

Rtel1, Regulator of telomere elongation helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtel1Q0VGM9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtel1Q0VGM9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtel1Q0VGM9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtel1Q0VGM9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtel1Q0VGM9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtel1Q0VGM9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtel1Q0VGM9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtel1Q0VGM9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtel1Q0VGM9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtel1Q0VGM9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtel1Q0VGM9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtel1Q0VGM9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtel1Q0VGM9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtel1Q0VGM9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtel1Q0VGM9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtel1Q0VGM9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtel1Q0VGM9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtel1Q0VGM9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtel1Q0VGM9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtel1Q0VGM9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtel1Q0VGM9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtel1Q0VGM9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtel1Q0VGM9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtel1Q0VGM9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtel1Q0VGM9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtel1Q0VGM9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtel1Q0VGM9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtel1Q0VGM9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtel1Q0VGM9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtel1Q0VGM9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtel1Q0VGM9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtel1Q0VGM9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtel1Q0VGM9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtel1Q0VGM9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtel1Q0VGM9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtel1Q0VGM9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtel1Q0VGM9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtel1Q0VGM9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtel1Q0VGM9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rtel1Q0VGM9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rtel1Q0VGM9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rtel1Q0VGM9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rtel1Q0VGM9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rtel1Q0VGM9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rtel1Q0VGM9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Rtel1Q0VGM9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rtel1Q0VGM9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rtel1Q0VGM9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rtel1Q0VGM9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rtel1Q0VGM9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rtel1Q0VGM9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rtel1Q0VGM9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rtel1Q0VGM9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rtel1Q0VGM9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rtel1Q0VGM9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rtel1Q0VGM9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rtel1Q0VGM9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rtel1Q0VGM9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rtel1Q0VGM9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rtel1Q0VGM9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rtel1Q0VGM9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rtel1Q0VGM9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rtel1Q0VGM9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rtel1Q0VGM9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rtel1Q0VGM9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rtel1Q0VGM9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rtel1Q0VGM9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtel1Q0VGM9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtel1Q0VGM9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtel1Q0VGM9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtel1Q0VGM9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtel1Q0VGM9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtel1Q0VGM9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtel1Q0VGM9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtel1Q0VGM9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtel1Q0VGM9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtel1Q0VGM9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtel1Q0VGM9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtel1Q0VGM9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtel1Q0VGM9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtel1Q0VGM9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtel1Q0VGM9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtel1Q0VGM9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtel1Q0VGM9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtel1Q0VGM9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtel1Q0VGM9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtel1Q0VGM9 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtel1Q0VGM9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtel1Q0VGM9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtel1Q0VGM9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtel1Q0VGM9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtel1Q0VGM9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtel1Q0VGM9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtel1Q0VGM9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtel1Q0VGM9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtel1Q0VGM9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtel1Q0VGM9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtel1Q0VGM9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtel1Q0VGM9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtel1Q0VGM9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms