Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ttc39dQ0VF76 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms