Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Vps8Q0P5W1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms