Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ubxn2bQ0KL01 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ubxn2bQ0KL01 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms