Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NeblQ0II04 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NeblQ0II04 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NeblQ0II04 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NeblQ0II04 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NeblQ0II04 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NeblQ0II04 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NeblQ0II04 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NeblQ0II04 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NeblQ0II04 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NeblQ0II04 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NeblQ0II04 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NeblQ0II04 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NeblQ0II04 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NeblQ0II04 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NeblQ0II04 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NeblQ0II04 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NeblQ0II04 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NeblQ0II04 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NeblQ0II04 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NeblQ0II04 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NeblQ0II04 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NeblQ0II04 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NeblQ0II04 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NeblQ0II04 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NeblQ0II04 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NeblQ0II04 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NeblQ0II04 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NeblQ0II04 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NeblQ0II04 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NeblQ0II04 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NeblQ0II04 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NeblQ0II04 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NeblQ0II04 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NeblQ0II04 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NeblQ0II04 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NeblQ0II04 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NeblQ0II04 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NeblQ0II04 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NeblQ0II04 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NeblQ0II04 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NeblQ0II04 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NeblQ0II04 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NeblQ0II04 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NeblQ0II04 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NeblQ0II04 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NeblQ0II04 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NeblQ0II04 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NeblQ0II04 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NeblQ0II04 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NeblQ0II04 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NeblQ0II04 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NeblQ0II04 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NeblQ0II04 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NeblQ0II04 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NeblQ0II04 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NeblQ0II04 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NeblQ0II04 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NeblQ0II04 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NeblQ0II04 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NeblQ0II04 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NeblQ0II04 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NeblQ0II04 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NeblQ0II04 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NeblQ0II04 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NeblQ0II04 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NeblQ0II04 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NeblQ0II04 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NeblQ0II04 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NeblQ0II04 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NeblQ0II04 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NeblQ0II04 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NeblQ0II04 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NeblQ0II04 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NeblQ0II04 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NeblQ0II04 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NeblQ0II04 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NeblQ0II04 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NeblQ0II04 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NeblQ0II04 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NeblQ0II04 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NeblQ0II04 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NeblQ0II04 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NeblQ0II04 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NeblQ0II04 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NeblQ0II04 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NeblQ0II04 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NeblQ0II04 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NeblQ0II04 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NeblQ0II04 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NeblQ0II04 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NeblQ0II04 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NeblQ0II04 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NeblQ0II04 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NeblQ0II04 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NeblQ0II04 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NeblQ0II04 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NeblQ0II04 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NeblQ0II04 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NeblQ0II04 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms