Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cass4Q08EC4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cass4Q08EC4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms