Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms