Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calb2Q08331 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms