Protein–RNA interactions for Protein: Q08297

Rad51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51Q08297 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rad51Q08297 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms