Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cnn1Q08091 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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