Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
NrepQ07475 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NrepQ07475 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NrepQ07475 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms