Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms