Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cntn3Q07409 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms