Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Siah2Q06986 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms