Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Siah1bQ06985 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Siah1bQ06985 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms