Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms