Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SPINDOCQ05AH6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms