Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Caprin2Q05A80 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Caprin2Q05A80 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms