Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sox10Q04888 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox10Q04888 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox10Q04888 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox10Q04888 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox10Q04888 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox10Q04888 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox10Q04888 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox10Q04888 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox10Q04888 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox10Q04888 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox10Q04888 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox10Q04888 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox10Q04888 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox10Q04888 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox10Q04888 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox10Q04888 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sox10Q04888 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox10Q04888 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox10Q04888 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox10Q04888 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox10Q04888 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sox10Q04888 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms