Protein–RNA interactions for Protein: Q04742

Emx1, Homeobox protein EMX1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx1Q04742 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms