Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smpd1Q04519 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms