Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms